Ausgehend von der Arbeit des Heimatvereines wurde das Hiltruper Museum 1984 unter der Leitung der heutigen Ehrenvorsitzenden des Museumsvereines, Bärbel Reisener, gegründet.
Der Verein Hiltruper Museum e.V. ist Träger des Museums. Er unterhält das von der Stadt Münster angemietete Gebäude, plant und führt Ausstellungen und Veranstaltungen durch. Zudem verwaltet er das Archiv des Hauses. Dem Vorstand des Vereines steht das Kuratorium beratend zur Seite.